英文:
2017 The Paradigmatic Crises in China’s Minzu Studies: Reflections from the Perspective of Human Development. Journal of Chinese Humanities, Vol.3(2). Pp135-155.
2013 Between the Sacred and the secular: A Case Study of FBOs in China. Inter-Asia Roundtable 2013 – Religion and Development in China: Innovations and Implications, NUS. Oct.2013 (新加坡国立大学亚洲论坛论文集)
2012 Lineage and Family, Chinese Society – Change and Transformation, edited by Li Peilin, London and New York: Routledge.
2004 Land Reform in Yang Village: Reproduction of Symbolic Capital and the Determination of Class Status. Modern China 30(1):1-48, Jan.2004. (SSCI)
2004 Symbolic Land Rights in Its Cultural Economic Context： A Case Study of Yang Village, Fujian. Social Sciences in China，winter, 2004, pp41-54. （《中国社会科学》英文版）
2002 Ancestral Hall and Buddhist Gongde Temple. Chinese Sociology and Anthropology. Vol.34, No.3, pp28-48. （SSCI）
中文：
2025 生命的可持续：人类发展与人类世的人类学，《原生态文化学刊》2025年第1期。
2024 宋以降佛教士庶化——福建功德寺院的个案研究，《云南师范大学学报》2024年4期。
2024 从社区发展、社会发展到人类发展，（张小军 萧泳红）《原生态文化学刊》2024年第1期。
2023 关于“人工智人”的认知人类学思考，《学术前沿》2023年12（下），第67-79页。人大复印报刊资料《社会学》2024年5期全文转载。
2023 回归“原梦”：自组织人类学的学术追求，《广西民族大学学报》2023年第6期，第1-10页。
2023 “主权意识“下的河西走廊——从《陕西舆图》看康熙年间的“边墙模式”（任昳霏、张小军），《清华大学学报》2023年第5期。
2023 人类的冰雪纪年与文化之道，《原生态文化学刊》2023年第4期。
2023 清华学派关于中国乡村出路之论——吴景超与“李约瑟之谜”的“文化续篇”，《清华社会学评论》第19辑。
2023 房、派、家：宗族单位与国家系谱——宋代谱牒与华南谱牒个案，《民俗研究》2023年第3期。
2022 中华民族共同体的文化认同，《原生态文化学刊》2022年第1期。
2022 共有中的私有与个有：一个老挝村庄的土地文化经济（郭迅羽、张小军），《广西民族大学学报》2022年第5期。
2021 让“社会”有“文化”，《清华社会学评论》2021年，第15辑，社科文献出版社。人大复印报刊资料《社会学》2021年第10期全文转载。
2021 跨学科悖论与历史人类学，《北大史学》（第21辑），赵世瑜主编，社科文献出版社2021年。
2021 文化共融：中国近代冰雪大众文化与社会转型，《清华大学学报》（杨宇菲、张小军），2021年第6期。人大报刊复印资料《文化研究》2022年3期转载。
2021 自我的它/他/她性：中国近代冰雪文化与女性现代性，《中央民族大学学报》（杨宇菲、张小军）2021年第6期。
2021 近代冰雪文化的民族主义及日常叙事，《湖北民族大学学报》（张小军、杨宇菲）2021年第5期。
2021 民国时期日常生活的冰雪文化与社会转型，《原生态文化学刊》（张小军、杨宇菲），2021年第6期。
2021 合作化的共生经济：日本生活合作社运动的根基，《探索与争鸣》（金海兰、张小军），2021年第4期。
2021 “祖国的历史”与“民族位育”——简论潘光旦先生的民族思想，《踏上健全与繁荣的大路——纪念潘光旦诞辰120周年论文集》（张小军、李芳），吕文浩主编，学苑出版社。
2020 中华民族共同体的差序格局及其文化实践，《广西民族大学学报》2020.1. 人大报刊复印资料《民族问题研究》2020年第5期全文转载。
2020 人工智能感官的主体性：感官人类学视角的思考（张小军、杨宇菲），《中央民族大学学报》2020年第2期。
2020 鬼与灵：西南少数民族的“鬼”观念与帝国政治，《节日研究》第14辑（《民俗研究》专辑）。
2018 世界的人类学与中国的民族学，《世界民族》2018年第5期，1-11页。《新华文摘》2018年第12期转载。
2018 当历史走进人类学家——评萧凤霞《踏迹寻中：四十年华南研究之旅》，《清华大学学报》2018年第1期。
2018 乡村社区自主发展的中国经验——走向共同体的乡村自治（张小军、雷李红）《江苏社会科学》2018年第3期。
2018 “鬼主”与圣权制——西南地区历史上的政俗国家化，（张小军、雷李红）《民俗研究》2018年第3期。
2018 中国研究的人类学“台湾学派”——李亦园先生学术追忆，《中南民族大学学报》2018年第5期。（张小军、李海文）
2017 何谓旅游？——旅游人类学视角的思考（张小军、吴毅），《旅游学刊》2017年7期。中国人民大学复印报刊资料《旅游管理》2017.10.全文转载。
2016 白水CDF启示：共有基础上的个人所有制——兼论破解经济学的歌德巴赫猜想，《开放时代》2016年第6期。
2016 “文治复兴”与民利主义的市场化政治，《思想战线》2016年第6期。
2016 天后北传与漕运贸易——一个文化资本的视角，《南京大学学报》2016年第4期。《新华文摘》2017年6期转载。
2016 “民族”研究的范式危机——从人类发展视角的思考，《清华大学学报》2016年第1期。
2016 哈尼族阿卡人的“措卡”治理制度——普洱市孟连县芒旧新寨的个案研究（张小军、李茜），《民族研究》，2016年第2期。
2016 学术：共同体的灵魂（学术共同体专题），《开放时代》2016年第4期。
2016 宋代文治复兴与儒家的政治文化实践/儒家何以能连接到社会主义（儒学与社会主义专题）。《开放时代》2016年第1期。
2016 强国之学：人类学的学科使命。《文汇学刊》，2016年5月30日。收录于《人类学的中国发展》，徐杰舜主编，中国人类学高级论坛主编，2016年。
2015 谁的村落？谁的集体？——集体化村落发展模式反思（集体经济村庄专题）《开放时代》2015年1期。
2015 漂泊中的永恒：一个人类学家的理想国，《广西民族大学学报》2015年第1期。
2014 走向“文化志”的人类学：传统民族志概念反思，《民族研究》2014年4期。 中国人民大学复印报刊资料《社会学》2014.11.全文转载。
2014 “韦伯命题”与宗族研究的范式危机，《山西大学学报》2014年6期。
2014 多民族地区的乡市化与文化区发展，《北方民族大学学报》（吴毅、张小军），2014年第6期。中国人民大学报刊复印资料《民族研究》2015年2期转载。
2014 过度商业化与民族文化多样性危机，《原生态文化学刊》（与张晓松）2014年第4期。《新华文摘》2015年转摘。
2013 权力互竞交换共同体——贵州水族霞节、艾节和善节的个案研究，《民族研究》2013年第2期。《中国社会科学文摘》2013年7期转载。
2013 “关键是保存文化母体”，《中国社会科学报》，2013年4月26日，A6版
2013 鬼与节的文化生态学思考，《民俗研究》2013年第1期。《社会学报》2013.2全文转载。中国人民大学“复印报刊资料”《文化研究》2013年第5期全文转载。
2012 人类学研究的文化范式——“波粒二象性”视野中的文化与社会，《中国农业大学学报》2012年第2期。中国人民大学复印报刊资料《社会学》2012.9全文转载
2012 为何他乡成故乡？——大槐树传说之集体记忆的民族主义建构。载《中国人类学》，2012年第1期。
2012 文治复兴与礼法变革——祠堂之制和祖先之礼的个案研究。《清华大学学报》，2012年第2期。《社会学》2012.7（中国人民大学复印报刊资料全文转发），上海《高校文科学术文摘》2012.3全文转发。《社会学报》2012.2全文转载。
2012 宗族与中国社会，《人类学讲堂》（第二辑）潘蛟主编，知识产权出版社。
2011 文化经济学的视野：“私有化”与“市场化”反思——兼论“广义科斯定理”和产权公平。《江苏社会科学》，2011年第6期。
2011 文化？文物？——简论文化遗产保护中的“文物化”困境。张小军，张晓松。《原生态民族文化学刊》2011年第3期。中国人民大学复印报刊资料《文化研究》2012年第2期全文转载。
2011 庙宇·水权·国家——山西介休源神庙的个案研究。载《大河上下——十世纪以来的北方城乡与民众生活》，山西人民出版社。
2010 “被族群”：丽江古城的文化保护困境。载《中国社会科学报》2010.9.2.
2010 境社信仰中的陈夫人——蓝田陈靖姑信仰个案研究。《中国首届临水夫人陈靖姑文化学术研讨会论文集》。
2009 中国12村贫困调查——晓锐村，张小军、马亚萍、朱宇晶。载《中国12村贫困调查》（甘肃、内蒙卷），张小军、马春华主编。社科文献出版社。
2009 中国12村贫困调查——乾分村，张小军、马亚萍、朱宇晶。载《中国12村贫困调查》（甘肃、内蒙卷），张小军、马春华主编。社科文献出版社。
2009 人类发展理念下的贫困问题反思，载《中国12村贫困调查》（理论卷），王晓毅主编，社科文献出版社2009年。
2009 咸与权：历史上自贡盐业的市场分析，《清华大学学报》2009第二期。人大报刊复印资料《社会学》2009年第6期转载。
2009 实践史:一个历史人类学的研究视角——以民间信仰研究为例，载《谁的信仰，谁的空间？》，复旦大学文史研究院编，上海古籍出版社。
2009 电影《色·戒》鉴赏的文化实践，载《异文化与多元媒体》，乔健主编，台北：世新大学出版中心。
2008 宗族与家族，载《社会学与中国社会》，社科文献出版社。
2008 文化生态与文化环保，载《绿叶——传统文化与现代化专辑》，中国环境文化促进会编。《中国社会科学文摘》2008年12期全文转摘。
2007 复合产权：一个实质论和资本体系的视角——山西介休洪山泉的历史水权个案研究，《社会学研究》，2007年第4期。
2007 爱的实践：艾滋病防治中的社会性别主流化。与许晶合作，载张小军主编《文化的挑战——文化全球化和社会发展的本土思考》，香港：中国世纪出版集团有限公司。
2007 秩序剥夺与城市底边阶级的形成，乔健主编《底边阶级与边缘社会》，台北：立绪文化事业有限公司。
2007 历史人类学：一个跨学科和去学科的视野。《清华历史讲堂初编》，三联书店2007年。
2007 遗存还是遗产？——简论文化全球化中的“文化遗产”困境，《中国非物质文化遗产保护研究》（上），北京师范大学出版社。
2006 产权改制与城市底边阶级的形成——兼论科斯逆定理与产权定理。台湾第七届（2003-2006）大学讲座计划“底边阶级的传统与现代”会议论文（2006.5.台北）。
2006 认知人类学浅谈，《光明日报》（理论版）2006年11月。
2006 社会围绕“现代化”和经济中轴安排的弊端，《中国与世界观察》，2006年第1期。
2006 《陕山地区水资源与民间社会调查资料集》补遗七则，张小军、卜永坚、丁荷声，香港：《华南研究资料中心通讯》第42期。
2006 谁在侵蚀中国文化的灵魂？《环球时报》第1180期，2006年6月13日第13版。
2005 城市贫困的制度思维，张小军、裴晓梅，《江苏社会科学》，2005年第6期。
2005 未画句号的“人类责任宪章”，《当代文明的困惑与追求——解读《人类责任宪章》》，赵轶峰、于硕主编，团结出版社。
2004 象征地权与文化经济——福建阳村的历史地权个案研究，《中国社会科学》2004年第3期
2003 历史的人类学化和人类学的历史化，《历史人类学学刊》1(1):1-28。
2003 阳村土改中的象征资本再生产，《中国乡村研究》，总第二辑，商务印书馆。
2003导言，李孝聪、邓小南、筱君（张小军），载黄竹三、冯俊杰编著，《洪洞介休水利碑刻辑录》,中华书局。
2002 宗族化中的功德寺院，《台湾宗教研究》第二卷，第一期。
2002 阳村的境社与宗族，《民俗曲艺》（宗教与地方社会专辑II），总第138期。
2001 传统文化生产中的象征性实践，《清华社会学评论》2001年第一期。
2001 象征资本的再生产——从阳村宗族论民国基层社会，《社会学研究》2001年第三期。
2002 佛寺与宗祠：泉州开元寺的历史个案研究〉，载《传统与变迁——华南的认同和文化》，北京：文津出版社。
1999 经济人类学，载庄孔韶主编《人类学通论》，山西教育出版社。
1999 文化的经营：福建阳村李氏宗祠“复兴”的研究，《经营文化》香港商务印书馆1999
1999 家与宗族结构关系的再思考，《中国家庭及其伦理》，台湾《汉学研究》杂志出版。
1998 理解中国乡村内卷化的机制，香港：《二十一世纪》1998年2月号。
1998 田野影像的民族志－－宗族「复兴」中的历史重构，《香港人类学》总第11期。
1996 女性与宗族，香港：《二十一世纪》1996年10月号（总第37期），页150-59。
1995 儒家何在？－－华南人类学田野考察，香港：《二十一世纪》1995年6月号。
1992 社会场的吸引进化，《中国人民大学学报》，1992年第2期
1991蒿洋民间宗教与信仰一瞥，《民俗研究》，1991年第3期
1991东西方文化的兴衰与自组织社会学研究，《社会科学研究》，1991年第6期。
1991中国现实文化选择中的知识分子，《青年思想家》1991年第1期。
1989本土方法学刍议，《社会学与社会调查》，1989年第5期。
1988 人格现代化，《中国人民大学学报》，1988年第5期。
