中山大学人文高等研究院创立于2009年，首任院长为甘阳教授。创办之初，中大高研院与博雅学院、通识教育部“三位一体”，共同致力于推动跨学科跨领域的学术前沿研究。2022年，中大高研院成为独立设置的校级实体学术机构，现任院长为谢湜教授。中大高研院以“传承学脉，激活思想”为宗旨，以人文与社会科学基础学科为主，致力于推动跨学科交叉研究并促进海内外交流合作。中大高研院的建设基于中大的学术特色与定位，充分借鉴国内外高水平大学高研院建设的宝贵经验，以驻访学者制度荟聚海内外大学和研究机构的资深学者以及有潜力的中青年学者，并以此聚集校内学者群体，带动校内青年学术骨干的成长，担负起凝聚中大人文社科学术共同体的使命。
高研院通过驻访学者机制，形成驻访学者与校内学者的学术组群，举办不同规模、不同形式的论坛、讲座、工作坊、学术考察等活动，提供师生共享的物理与思想空间，打破学科与专业分界，激发学术交流与思想碰撞，从而营造充满活力的中大人文社会科学公共学术空间。高研院还与中山大学人文社科各院系开展人才培养合作，与各学科专业共同进行跨学科人才培养，为学生提供前沿、开放的学术资源，包括高研院读书会和“逸仙进阶讲堂”系列课程等。
高研院主要机构由学术委员会和行政办公室组成。高研院的学术团队由中山大学各院系的优秀学者和海内外驻访学者两部分组成。
