1）林月惠撰：《诠释与工夫——宋明理学的超越蕲向与内在辩证》( 增订版)。共 470页。台北市：中研院中国文哲研究所。2012年12月。
2）林月惠撰：《异曲同调—— 朱子学与朝鲜性理学》。共512页。台北市：台大出版中心。2010年5月。
3） 林月惠撰：《阳明「内圣之学」研究》。共170页。台北：花木兰出版社。收入林庆彰主编：《中国学术思想研究辑刊》三编，第20册。2009年3月。
4）林月惠撰：《良知学的转折——聂双江与罗念庵想之研究》。共773页。台北市：台大出版中心。2005年9月。
5）林月惠主编：《东亚儒学与经典诠释：韩国与越南儒学的开展》。共320页。台北市：“中研院”中国文哲研究所。2022年1月。
6）林月惠、李明辉主编：《韩国儒学日文研究论集》。共546页。台北市： “中研院”中国文哲研究所。2021年8月。
7）林月惠主编：《中国哲学的当代议题：气与身体》。共270页。台北市：“中研院”中国文哲研究所。2019年11月。
8） 林月惠、李明辉编校。《四端七情论》。共585页。台北市：“中研院”中国文哲研究所。2019年2月。
9） 林月惠、李明辉编。《高桥亨与韩国儒学研究》。共577页。台北市：台大出版中心。2015年7月。
