论文：
1.“Kungang: The Making of an Imaginary Archaeological Culture,” co-author with Victor H. Mair. Sino-Platonic Papers, number. 237.
2.“Research on the Identification between Tiele and the Oγuric Tribes,” in Archivum Eurasiae Medii Aevi, vol. 19, 2012.
3.《中国北方的草原遗珍：宾大博物馆所藏鄂尔多斯式青铜器》，与江然婷合著，《紫禁城》 2015年第1期.
4.“The Relationship of the Early Turks with the Wusun,” co-author with Victor H. Mair, in Central Eurasia in the Middle Ages, edited by Istvan Zimonyi and Osman Karatay, Turcologica 104, Harrassowitz Verlag, 2016.
5.“From entertainment to political life: Royal falconry in China between the 6th and 14th centuries,” in Pre-modern Falconry and Bird Symbolism – Interdisciplinary and Practical Consideration: the global perspective in relation to northern Europe, Germany: Druckhaus Köthen, 2018.
6.“Ancient Chinese falconry terminology,” co-author with Leopold Eisenlohr, in Pre-modern Falconry and Bird Symbolism – Interdisciplinary and Practical Consideration: the global perspective in relation to northern Europe, Germany: Druckhaus Köthen, 2018.
7.“Chinese Nomadic Art and The Journey to Collect: The Legacy of the Mayer Collection,” in Expedition, The Magazine of the University of Pennsylvania Museum of Archaeology and Anthropology, 2016, winter.
8.“Pleasing the Emperor: Revisiting the Chinese Manuscripts of Matteo Ricci’s Maps,” in Journal of Jesuit Studies, 6.1, 2019.
9.程方毅；“明末清初汉文西书中‘海族’文本知识溯源”；《安徽大学学报（社会科学版）》；2019年11月10日；第6期。
10.“试论以庄士敦为纽带的溥仪小朝廷社交活动 ——从一张被误读的老照片说起”；《溥仪及其时代》；2020年9月30日；第36卷，第3期。
11. “末代皇后の教師任薩姆について”；《國際的視野のなかの溥儀とその時代》；风响社株式会社出版；2021年3月25日；ISBN978-4-89489-809-7
12.“Evolution of Sinicization,” in Journal of Royal Asiatic Society, Volume 31 , Issue 2 , April 2021 , pp. 321 – 342.
13. 程方毅； “语境交织与媒介跨越——清末《时局图》再探”，《史林》；2021年8月；第4期。
专著:
《海妖之歌：横跨欧亚的奇幻之旅》（通俗写作），北京：商务印书馆，2015年。
访谈:
《“红色汉学家”的中国学缘——李克访谈录》，载于《战略与管理》2016年第2期。
翻译:
1. 约瑟夫·尼格，《海怪 : 欧洲古〈海图〉异兽图考》, 与江然婷合译，北京美术摄影出版社，2017年。
2.帕特里克·格里, 《蛮族与族性》，与江然婷合译，《历史、记忆与书写》，罗新主编，北京大学出版社，2018年5月。
